Қоғамның негізгі мақсаттары:

• балалар хирургтарының кәсіби өсуіне қолдау көрсету;
• балалар хирургиясын дамыту және насихаттау;
• өз мүшелерінің кәсіби, құқықтық, әлеуметтік мүдделерін қорғау;
• балалар хирургиясы саласында мемлекеттік саясатты қалыптастыру және жүзеге асыруға қатысу болып табылады.

Қоғамның қызметінің бағыттары:

• балалар хирургиясы саласындағы мамандарды тәжірибе алмасу үшін біріктіру;
• конференциялар, симпозиумдар, мастер-кластар ұйымдастыру;
• мамандарды даярлау және біліктілігін арттыруға қатысу;
• халықаралық кәсіби ұйымдармен өзара іс-қимыл жасау;
• ғылыми-зерттеу және білім беру қызметі.